O curso de Mestrado em Estudos Cristãos, oferecido pela FITRef, é voltado para alunos que já têm bacharelato e querem fazer uma especialização em Estudos Cristãos e Bíblia, sem objetivar a formação para o pastorado e sem estudar a Bíblia nas línguas originais. Este mestrado não é do mesmo nível acadêmico do tradicional Mestrado em Teologia (Th. M.).
Visto que este curso visa a especialização em Bíblia e não a formação em Bíblia em nível de bacharelato, os que a ele se candidatarem devem ser formados no Bacharelato em Estudos Cristãos da FITRef ou devem ser bacharéis que também cursaram as seguintes disciplinas do B. C. S. da FITRef (ou equivalentes em uma outra instituição idônea):
HU 102 Inglês I, HU 105 Cosmovisão Cristã, BI 101 Introdução à Bíblia I, PR 101 Formação Espiritual, HU 202 Inglês II, HU 203 Introdução à Psicologia (da perspectiva bíblica), HU 204 Casamento e Família, BI 201 Introdução à Bíblia II, BI 202 Hermenêutica, HU 302 Introdução à Filosofia, BI 303 Metodologia da Pesquisa Exegética, AP 301 Apologética, TS 301 Introdução, Revelação e Teontologia, TS 402 Ética Cristã, BI 403 Teologia da Aliança I, TS 401 Criação, Providência e Antropologia. Em alguns casos se pode substituir uma outra disciplina do curso de B. C. S.
Recomendam-se também as seguintes disciplinas: BI 305 Evangelhos, BI 404 Pentateuco, BI 301 Grego I , e BI 402 Hebraico I. Para estudantes interessados na história da Igreja, recomendam-se HI 101 História da Igreja Primitiva e HI 201 História da Igreja Medieval.
Para a concessão de diploma de BCS a bacharel formado por outra instituição, é necessário que o aluno curse, com êxito, na FITRef, 10 disciplinas do nível de bacharelato, e curse ou obtenha o aproveitamento de 10 disciplinas do nível de 300 ou 400.
2O programa completo do curso consiste no acúmulo, bem sucedido, de 20 disciplinas ou 60 créditos. Cada disciplina é composta de 30 horas-aulas virtuais e 15 horas-aulas de atividades práticas, correspondendo a um total de 3 créditos.
A divisão do curso em dois anos segue as convenções norte-americanas. O aluno da FITRef que estudar 2 disciplinas por período pode completar o curso em 30 meses. Quem estudar em tempo integral pode terminá-lo em 12 a 15 meses. Segue o programa do curso:
